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  2015年11月4-5日,第四届全国生物多样性信息学研讨会在广西南宁举行。本次会议由中国科学院科技促进发展局、环境保护部自然生态保护司、中国科学院生物多样性委员会、国际科技数据委员会中国全国委员会共同举办,广西壮族自治区药用植物园承办。103名正式注册代表来自47家单位:除科学院10个研究所39名代表之外,还有来自国际组织、大学、研究所、自然保护区、标本馆、博物馆、出版社、编辑部等机构,以及中研院的代表参加了研讨会。

  4日上午,中国科学院生物多样性委员会副主任、中科院植物所马克平研究员主持开幕式、广西自治区中医药管理局副局长彭跃刚致开幕词。本次的大会报告内容十分精彩:组委会不仅邀请了学科本身的专家,也邀请了“圈外”和本领域在国际上第一方阵的知名人士。

  中科院计算机网络信息中心科学数据中心主任黎建辉研究员以“科学数据出版与引用”作为开场大会报告,详尽讲述了数据网络出版、开放和引用的现状;介绍探索性工作如:在线刊物《中国科学数据》等学术期刊的数据引用,长期观测数据开放的价值和推动共享的深远意义;基于“价值是被用户认可”这一理念,大力推行在线数据开放的具体步骤和流程,对未来数据的发布和引用将成为规范从而进行数据共享的展望。来自网络生命大百科(EOL)运营总监Robert  Corrigan的报告“EOL TraitBank: An open digital repository for organism traits”形象地以科研数据的使用不像农民去田里收获果实那么容易展开演讲,阐述科研数据的产生如同一棵树的生长是很快的,而科研文章的发表和数据库的产生相对较慢,举实例说明已发表文章的信息提取供研究者使用方面EOL的共享数据仓库(TraitBank)所做的开发:数据类型根据量度、统计值和性状(measurements, statistics and facts)进行分类,数据共享策略和近1100万条在线数据信息(http://eol.org/statistics/data)等。微软亚洲研究院常务副院长芮勇博士报告“智能视觉识别系统:广于万物、专于花卉”生动地展示了微软亚洲研究院在计算机视觉方面近期所取得的研究成果,如:基于微软牛津计划开发的APP:你多少岁(how-old.net);深度学习结合大数据识别可以做到计算机物体识别和降低错误率;视频展示计算机可以做到的分类视频和人类眼见已经非常接近的新技术等。结合本次会议主题,芮勇博士提议要将生物多样性信息学做得更好需要三个方面:大数据、生物领域的专业知识和计算机深度学习等算法,芮勇博士同时表达了希望未来与中科院植物所有更进一步合作,特别是植物和动物识别方向。全球生物多样性信息网络(GBIF)执行主任Donald Hobern博士的报告“Organising Global Biodiversity Data–Challenges and Opportunities”提出:理解和很好地使用数据能够帮助政府合理制定政策和进行生物多样性保护,好的模型必须有高质量的数据支持;GBIF所做的正是集成全球数据提供给各方完全免费共享;提高数据质量和填补数据覆盖空白区是他们近期的工作重点,推动完整的生物物种名录的整合与审定工作,优先考虑与相关机构共建共享知识库。同时,举办系列讲座、展开培训和提供实用工具,用于鼓励和帮助更多国家和研究机构收集、整理和使用数据。马克平研究员的报告“生物多样性信息学及其相关研究进展”从生物多样性信息学的学科名称由来、主要内容(包括名字、基础资料数字化、标准和分析工具)和本领域的全球和国内重要项目进展进行了全面介绍,包括中国科学院为主推动的《中国生物物种名录》(印刷版)的物种信息更新情况、国家标本资源共享平台(NSII)、生物多样性历史文献图书馆(BHL)等,以及亚洲生物多样性保护与信息网络(ABCDNet)的最新进展与规划:重点推动亚洲植物制图(MAP)和东南亚生物多样性信息平台(SEABio)。

  所有大会报告精彩纷呈,场上参会者提问热烈,尤其研究生们不怯场、英文提问的自信令人印象深刻。

  在分会场报告中,6个专题共有48个报告分别就生物名录与志书编研及数字化、标本数字化与信息共享、数字植物园与保护区数字标本馆、生物多样性网站开发维护与评价、公众科学与信息传播、生物多样性在线资源演示会等展开交流与互动。其中公众科学与信息传播、生物多样性在线资源演示专题是根据上届参会者的提议首次设置的,现场演示网站的各项功能和用户体验,旨在推进公民科普和社会大众的广泛参与。

  5日下午,承办单位广西药用植物园李力副书记主持了闭幕式。马克平进行了总结:本次会议很成功,感谢大家的积极参与和支持。生物多样性信息学近几年在我国发展很快,此次会议进行了很好地总结与展示;与相关的主流国际项目积极互动与合作,形成双赢的局面,为未来中国生物多样性信息学的发展奠定了基础。今后我们将以不同方式推动中国的生物多样性信息学发展,比如举办数据挖掘、网站建设、名录等方面的培训班,向社会进行推广;通过网络等渠道将我们的成果和进展向国外进行推介;重视科普和社会参与等。

  至此,本次研讨会圆满结束。通过研讨会的契机使大家齐聚一堂,展开交流与互动。不仅学习他人的先进经验和学术思想,同时将我们的工作介绍给国际同行,形成良好的发展态势。

  会议开幕式

  

  马克平研究员作大会报告

  

  与会人员合影